农村土地确权登记后所颁发的土地承包经营权证书遗失的，可以向农业委员会申请补办。属于原来颁发的土地承包经营权证书丢失的，则不需要补办，可以直接申请重新确权登记。
土地所有权、土地使用权和他项权利的确认、确定，简称确权。是依照法律、的规定确定某一范围内的土地（或称一宗地）的所有权、使用权的隶属关系和他项权利的内容。
每宗地的土地权属要经过土地登记申请、地籍调查、核属审核、登记注册、颁发土地证书等土地登记程序，才能得到最后的确认和确定。2013年1月31日下发的一号文件提出，全面开展农村土地确权登记颁证工作。
法律依据：办理流程及所需证件资料如下：1.本人申请书；2.本村介绍信；3.本人提供的在县市级以上电视台或地市级以上报刊的公告、声明的相关手续，同时应在本村公示七天以上；4.原“换发农村土地承包经营权证申请表”的复印件；5.乡（镇）经管中心重新填写并编码、盖章的“换发农村土地承包经营权证申请表”。