法律分析:
机关办理刑事案件程序是：
1.立案；
2.侦查；
3.制作起诉意见书报送检察机关审查起诉；
4.如果检察机关退回补充侦查的，还得继续补充侦查。《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百六十二条
机关侦查终结的案件，应当做到犯罪事实清楚，证据确实、充分，并且写出起诉意见书，连同案卷材料、证据一并移送同级人民审查决定；同时将案件移送情况告知犯罪嫌疑人及其辩护律师。
犯罪嫌疑人自愿认罪的，应当记录在案，随案移送，并在起诉意见书中写明有关情况。