当公司法人不在了，公司仍然可以继续运营，除非公司面临破产、注销或倒闭的情况。以下是处理公司法人不在的具体步骤：
1、确认法定代表人的去世。首先需要确认公司法人（法定代表人）是否真的去世。
2、召开股东会议。如果法人代表去世，公司应召开股东会议，重新选举新的法定代表人。
3、办理变更登记。新法定代表人选出后，需要到工商局ȡ办理变更登记手续，包括修改公司章程和股东名册中有关股东及其出资额的记载。
4、继承股东资格。如果自然人股东去世，其合法继承人可以继承股东资格，除非公司章程有其他规定。
变更公司法人的具体流程
1、在公司登记所在地的工商局网站进行公司法人变更预约。
2、在公司登记所在地的工商局网站上下相应的资料，并如实填写。
3、带上材料到工商局取预约号，交材料。
4、若材料有疑问或当地工商局还要求其他证明，则补充材料。
5、若材料无疑问或补充完毕并通过则领取变更通知书。
综上所述，法人不在了，公司应当依法选举新的法定代表人，完成工商变更登记，并在必要时组织清算，处理债权债务，最后进行注销或转让。
【法律依据】：
《中华人民共和国公司法》
第七条
依法设立的公司，由公司登记机关发给公司营业执照。公司营业执照签发日期为公司成立日期。
公司营业执照应当载明公司的名称、住所、注册资本、经营范围、法定代表人姓名等事项。
公司营业执照记载的事项发生变更的，公司应当依法办理变更登记，由公司登记机关换发营业执照。