普通员工上班时感染新型冠状病毒是不能认定工伤的；根据发布的《关于因履行工作职责感染新型冠状病毒肺炎的医护及相关工作人员有关保障问题的通知》的规定：不是从事新冠肺炎预防和相关工作人员，感染新冠肺炎不能认定为工伤。