给个列子参考：
x1 = [0:.1:40];
y1 = 4.*cos(x1)./(x1+2);
x2 = [1:.2:20];
y2 = x2.^2./x2.^3;
hl1 = line(x1,y1,'Color','r');
ax1 = gca;
set(ax1,'XColor','r','YColor','r')
ax2 = axes('Position',get(ax1,'Position'),...
'XAxisLocation','top',...
'YAxisLocation','right',...
'Color','none',...
'XColor','k','YColor','k');
hl2 = line(x2,y2,'Color','k','Parent',ax2);
以下解答仅供参考
对于楼主的问题，常见的解决办法是双坐标系。
1)双纵轴坐标系
双坐标系一般又是共横轴，异纵轴。可否让原来的y当横轴，不同的x轴当y轴呢？
双坐标系画图命令：plotyy(x,y1,x,y2);
给个例子：
x=-pi:2*pi/100:pi;
y1=sin(x);
y2=x;
plotyy(x,y1,x,y2);
2）双横轴坐标系：
给个例子
%第一个图
x1=linspace(-6,6);
plot(x1,sin(x1));
set(gca,'xcolor','b');
box off;
ylim([-2,2]);
%第二个图
axes;
x2=linspace(-1,1);
h=plot(x2,2*sin(x2),'r');
set(gca,'xaxislocation','top','color','none','xcolor','r');
box off;
ylim([-2,2]);